Исследователи из Пенсильванского университета и Института рака Dana-Farber применили комбинацию методов иммунопреципитации хроматина и массивно-параллельного секвенирования для изучения взаимодействия между геномной ДНК и энзимом гистон-диацетилаза-3 (HDAC3) в печени мышей, у которых поддерживался специфический цикл смены светлого-темного времени суток и режим питания.
Результаты исследования показали, что уровень взаимодействия HDAC3 и геномной ДНК менялся в зависимости от циркадного цикла печени, резко падая в ночное время, когда мыши были активны и получали пищу, и достигая пиковых показателей днем, когда животные спали — в этот период HDAC3 был связан более чем с 14 тыс. участками генома печени мыши (для сравнения: в ночное время — лишь со 120 сайтами). Ученые обнаружили, что в период активного взаимодействия с геномной ДНК энзим активизирует гены, отвечающие за метаболизм липидов, и поддерживает их в состоянии меньшей активности днем, когда мыши спали. По мнению исследователей, возможно, именно этот механизм регуляции предотвращает развитие жирового гепатоза. Соответственно, нарушение циркадного ритма обмена веществ может приводить к развитию жировой дистрофии печени.