Сегодня в Новокузнецке работает только один магнитно-резонаторный томограф, и врачи-нейрохирурги вынуждены отправлять больных на диагностирование в другую больницу. Новое современное оборудование значительно улучшит качество диагностики и лечения пациентов не только Новокузнецка, но и других городов Юга Кузбасса. Для размещения аппарата выбрано оптимально подходящее по всем техническим требованиям помещение в хирургическом корпусе №1.
В 2008 году по распоряжению губернатора области Амана Тулеева для ГКБ №29 из областного бюджета были выделены денежные средства на приобретение магнитно-резонансного томографа. В июле был заключен контракт на поставку МРТ стоимостью 48 млн. рублей. В связи со сжатыми сроками и сложностью выполнения проектных и строительно-монтажных работ был решён ряд проблем, в том числе связанных с выбором подрядной организации и привлечением дополнительных денежных средств. По распоряжению главы Новокузнецка Сергея Мартина из городского бюджета было выделено 8 млн. рублей.