Ежегодно в педиатрическом отделении проходят лечение около 1.600 детей. Потребность в стационарной помощи для детей остается достаточно высокой.
В 2009 году по инициативе депутата Госдумы РФ Татьяны Яковлевой и губернатора Михаила Меня в Министерство здравоохранения и социального развития РФ было направлено обращение с просьбой выделить средства из резервного фонда президента РФ на капитальный ремонт лечебного учреждения. В результате для Шуйской больницы было выделено 8,2 млн рублей. Кроме того, из бюджета муниципалитета на ремонтные работы и приобретение мебели для детского корпуса дополнительно направлено 2,75 млн рублей.
В детском отделении Шуйской ЦРБ 45 коек: 30 коек круглосуточного стационара и 15 - дневного. В торжественном открытии после ремонта детского корпуса приняли участие губернатор Ивановской области Михаил Мень, депутаты регионального парламента Анатолий Буров и Олег Воробьёв, представители комплекса социальной сферы региона.