Новый глава амурского минздрава в 1995 году окончил Самарский государственный медицинский университет по специальности лечебное дело. Второе высшее образование получил по специальности \"Бухгалтерский учет и аудит\", окончив в 1998 году Самарскую государственную экономическую академию. Параллельно Алексей Спирин проходил интернатуру и ординатуру в Пензенском институте усовершенствования врачей. Ему присвоена квалификация врача-хирурга.
Трудовую деятельность Спирин начал в должности врача-хирурга. В 2000 году назначен главным врачом в Самарском областном диагностическом центре. Имеет опыт внедрения новых технологий. При нем был открыт первый и до сих пор единственный в регионе \"Центр планирования семьи и репродукции\" с современной лабораторией, а также \"Диабетологический центр\". Во время работы главврачом поликлиники Самары создал второе по величине в городе стоматологическое объединение, организовал школу для больных артериальной гипертонией, организовал отделение профилактики.
С 2006 года возглавил одно из управлений министерства здравоохранения и социального развития Самарской области. Вплоть до назначения на должность министра в Амурской области занимался организацией медико-санитарной помощи и реализацией профильных проектов. Под его руководством проводилась реформа, направленная на совершенствование организации оказания амбулаторно-поликлинической помощи. В частности, изданы единственные в России методические рекомендации на эту тему. Алексей Спирин был ответственным за организацию взаимодействия с Минздравсоцразвития РФ, а также сотрудничество с фондами обязательного медицинского и социального страхования.
В апреле 2010 г. успешно прошел аттестацию - присвоен чин действительного государственного советника 1 класса. Это высшая должность госслужбы региона. Алексей Спирин имеет ученую степень кандидата медицинских наук и высшую квалификационную категорию по организации здравоохранения, сертификаты по организации здравоохранения и хирургии.